Sau sự kiện mùa đầu, Mason, Nadia và Bernard tiếp tục bị săn đuổi khi một âm mưu mới xuất hiện, lần này liên quan đến một mối đe dọa toàn cầu có thể "thay đổi cả nhân loại". Bộ ba buộc phải tái hợp, tuyển mộ thêm những đặc vụ mới "khác người" và thực hiện các nhiệm vụ xuyên quốc gia để ngăn chặn Tổ chức Manticore. Mùa 2 này đóng vai trò cầu nối quan trọng, liên kết chặt chẽ hơn với các phần phim ngoại truyện đã ra mắt trước đó như Citadel: Diana (Ý) và Citadel: Honey Bunny (Ấn Độ), tạo nên một vũ trụ gián điệp đa quốc gia rộng lớn và được đánh giá là mùa phim có phong cách rất “bom tấn Hollywood” với nhiều cảnh cháy nổ được đầu tư mạnh tay vào kỹ xảo và các cảnh quay hành động cận chiến mãn nhãn tại nhiều địa điểm trên thế giới.